梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象,本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后,樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园,一如既往的过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了,变成了勤勉努力,热衷体育的开朗青年。到现在朋友白河小鸟,天枷美春,水越真子,杉并都没有变化,除了两年前离去的妹妹——朝仓音梦。