在前作中，雷门十一人成功达成了找回真正的足球的革命在神圣之路大赛后，主角松风天马为了教孩子们足球而来到了冲绳当活动结束后，回到雷门的天马在那目击到不得了的异变！在神圣之路得到优胜，应该是回到了和平的生活中，忽然出现了被称为最终协议的足球队从两百年后的未来出现的他们，其目的就是要把足球运动从这个世界上抹消掉当天马被压倒性的力量打得落花流水的时候，出现了一位谜之少年菲伸出了援手。天马他们为了要阻止足球消失，展开了穿越时空的冒险旅程。穿梭过去与未来的冒险剧正式开始！！
