《侦探歌剧:少女福尔摩斯》以架空的怪盗和侦探活跃的近未来为背景在这个世界里存在着有被叫做“Toys”的特殊能力的人类利用这种特殊的能力,“侦探”和“怪盗”争斗不断。而故事就是以将来要为侦探的四个少女夏洛克、妮洛、艾露克露、柯蒂妮娅为中心展开的。