2053年,忽然呈现的宇宙生命体侵略了地球,直接招致了地球上人口损失过半,在人类方面军还击作战失败之后,日本方面军在富士基地展开了一项名为“Planzet”的最终作战方案。机动兵士驾驶员明岛大志接到了死守作战基地的命令,只许死守不准失败,在这场作战前夕,大志将本人的妹妹与家人送往平安的火星避难。